Ban đầu, cổ động viên của Hà Nội FC thường là tầng lớp trung niên đi thưởng thức không khí bóng đá ngày cuối tuần. Đã có một thời gian Tập đoàn T&T từng phải kêu gọi nhân viên, người thân đến xem, thậm chí còn bỏ tiền thuê cổ động viên đến theo dõi để cho khán đài sân Hàng Đẫy đỡ hiu quạnh. Việc phải thuê cổ động viên hay kê khống số lượng cổ động viên đã khiến câu lạc bộ nhiều lần bị mỉa mai.[46] Trong nhiều trận đấu diễn ra tại đây, số lượng cố động viên đội khách áp đảo lực lượng của đội chủ nhà.[47] Thời điểm năm 2013, sau khi CLB Hà Nội của bầu Kiên ngừng hoạt động, chỉ còn Hà Nội T&T chơi ở V.League, một người sống gần sân Hàng Đẫy thú nhận: "Càng ngày sân Hàng Đẫy càng vắng vì người Hà Nội không mấy gắn bó với đội bóng hiện nay".[48]

Đội bóng có một hội cổ động viên thành lập vào 2015 mang tên Contras Hanoi với đa phần là học sinh, sinh viên và những người trẻ tuổi hâm mộ đội bóng. Contras Hanoi thường cổ vũ bằng trống và fanchant cùng trống, băng rôn cỡ lớn. Ban đầu, hội cổ động viên có 15 thành viên, tới năm 2018 là hơn 300 thành viên. Hội cổ động viên này nhận được sự ủng hộ mạnh mẽ cả về tinh thần lẫn tài chính từ ban lãnh đạo đội bóng.[49]